Jornadas de Geografía Informática aplicada a las ciencias naturales en el MNCN (Cuarta Edición)

El Laboratorio de Biogeografía Informática y la Vicedirección de Formación del Museo Nacional de Ciencias Naturales (MNCN-CSIC) organizan la cuarta edición de las Jornadas de Geografía Informática, unas sesiones formativas sobre los aspectos básicos del trabajo con datos geoespaciales.

Dirigido a: investigadores, estudiantes, técnicos y ayudantes de investigación del MNCN.

Duración: cada sesión será de 4 horas, comenzando a las 9:30.

Metodología: explicación de conceptos teóricos y ejecución de ejercicios prácticos en el ordenador, alternativamente.

Lugar: sala de reuniones del edificio de Zoología.

Fechas:  31 de enero; 2,7,9,14,16, 21 y 23 de febrero de 2023. Martes y jueves de cada semana.

 

Curso impartido presencial y en línea, necesaria la inscripción previa escribiendo a:  formacion@mncn.csic.es

PLAZAS COMPLETAS

 

Jornada 1

 

Los metadatos de información geográfica

31 de enero de 2023

Imparten: Cristina Ronquillo y Victoria González

Objetivos

  • Mejorar el proceso de búsqueda de información geográfica mediante el uso de los metadatos de descubrimiento, exploración y explotación.
  • Aprender cómo funcionan los metadatos en ecología.

Material necesario

Un ordenador por participante con QGIS 3.22 instalado.

Aprendizaje

  • Entender los metadatos en distintos formatos y elegir la información adecuada para mi proyecto.
  • Mejorará la búsqueda de información geográfica en los catálogos oficiales.
  • Conocer y saber interpretar los principales términos y estándares de metadatos usados para trabajar con registros biológicos.
  • Aplicación en datos ya disponibles y para la publicación de nuestros propios sets de datos creados durante la investigación.

Contenidos

  1. Metadatos.
  2. Normativa: ISO19115, ISO19139, NEM.
  3. Herramientas para crear y validar metadatos geográficos.
  4. Servicio de catálogo.
  5. Ejercicio XML, entendiendo el XML.
  6. Ejercicio con QGIS.
  7. Introducción a los estándares de metadatos sobre biodiversidad: EML (Ecological Metadata Language), Darwin Core y Dublin Core.

 

Jornada 2

 

Nociones básicas de sistemas de referenciación geográfica

2 de febrero de 2023

Imparte: Victoria González

Objetivos

  • Conocer y entender nociones de los sistemas de referenciación geográfica.
  • Saber en qué sistema está cada una de las informaciones que incluimos en nuestros modelos y cómo podemos utilizar herramientas correctas de conversión entre unos sistemas de referenciación geográficos y otros para poder ingresar la información correctamente georeferenciada y proyectada en nuestros cálculos.
  • Aprender sistemas de conversión de formatos de las coordenadas utilizando conversores programados por servicios públicos oficiales.
  • Ser capaces de entender los metadatos de la información recibida en los proyectos de investigación y manejarla adecuadamente en lo referente a sistemas de referenciación geográfica y proyecciones.
  • Siguiendo con las situaciones observadas en el MNCN, trabajaremos con SRG modernos y antiguos, y cómo compatibilizar las muestras tomadas en la actualidad con capas de información descargadas de servidores.
  • Cómo incluir la georreferenciación de las muestras guardadas en colecciones históricas o encontradas en publicaciones en los proyectos.

Material necesario

Un ordenador por participante con el software QGIS 3.22 instalado.

Aprendizaje

  • Leer metadatos geográficos y entenderlos.
  • Sabrás en que proyección esta cada información que manejas y cuándo tienes que intervenir o cuándo son compatibles unas con otras.
  • Qué herramientas puedes utilizar para homogeneizar la información y cómo aplicarlas resolviendo rápida y eficazmente un problema geográfico.
  • Dominarás conceptos como geoide, elipsoide, datum, altura elipsoidal y altura ortométrica. Sabrás por qué tienes que conocerlos.

Contenidos

  1. Introducción: necesidad de orientación en nuestros datos científicos.
  2. Para tomar datos en campo necesitamos conocer las coordenadas y el sistema de referencia geográfica que utilizamos.
  3. Para usar cartografía temática digital tenemos que usar el mismo sistema de referencia geográfica que utilizamos en la toma de datos en campo para que esos datos coincidan antes de meterlos en un modelo.
  4. Distintos SRG en distintas épocas. ¿Por qué cambia tanto algo que en realidad permanece?
  5. La forma de la Tierra y las diferentes abstracciones con las que nos acercamos a ellas: elipsoide, geoide, relieve topográfico. Un repaso sencillo que nos ayuda a movernos por una realidad compleja.

 

Jornada 3

 

Toma de información en campo digital. Proceso de gestión de información geográfica desde el campo al modelo estadístico completamente digital

7 de febrero de 2023

Imparte: Victoria González

Objetivos

  • Con el objetivo de mejorar la calidad de la información geográfica producida durante el proyecto científico, se ofrece un sistema de gestión de esta información completamente digital en el que se utiliza software libre y dispositivos preexistentes.
  • Una jornada práctica donde podremos generar un proyecto, tomar información y descargarla en nuestro ordenador.
  • Conoceremos los metadatos que tiene cada una de las informaciones que manejamos y cómo podemos armonizar estos metadatos para su posterior tratamiento y análisis, en hojas de cálculo o programas estadísticos.

Material necesario

Un Smartphone con espacio y acceso a la WIFI y un ordenador por participante con Excel instalado.

Aprendizaje

  • Toma de datos de campo geográficos y temáticos de forma rápida y eficaz, traslado a un servidor y descarga en el propio ordenador.
  • Conversión posterior de esos datos en tablas planas y prepararlos para calcular modelos.

Contenidos

  1. Necesidad de tomar los datos en campo digitalmente y cómo hacerlo.
  2. Generar un proyecto adaptado, ver qué informaciones se pueden recoger y cómo diseñarlo.
  3. Hacer un ejercicio práctico de diseño, toma de datos, subida al servidor, descarga en local.
  4. Tratamiento final de la información capturada.

 

Jornada 4

 

Nociones básicas de sistemas de información geográfica aplicado a las ciencias naturales con QGIS

9 de febrero de 2023

Imparte: Victoria González

Objetivos

  • Conocer utilidades de los Sistemas de Información Geográfica (SIG) aplicados a las ciencias naturales.
  • Saber qué es un SIG, cómo se guardan los datos dentro de él, qué estructura tienen, cómo podemos utilizarlo para guardar los puntos de toma de datos en campo con toda la información capturada en ellos y completar la información temática de nuestro proyecto de investigación.
  • Generar informes que nos sirvan en el proyecto.

Material necesario

Un ordenador por participante con el software QGIS 3.22, software libre instalado.

Aprendizaje

Aprenderemos cómo leer la información en diferentes formatos, cómo consumir un servicio online de cartografía con un navegador pesado, modificar la información, superponerla correctamente atendiendo a su sistema de referenciación, su precisión, usar varias informaciones disponibles en internet, cargarla en tus bases de datos y exportarla.

Contenidos

  1. Introducción: qué es un SIG y para qué sirve en un proyecto de ciencias naturales.
  2. Qué tipos de información almacena.
  3. Qué informaciones es importante cargar en la base de datos y cómo gestionarla.
  4. Qué comandos pueden ser útiles para nuestro proyecto.
  5. Cómo exportar información para meterla en nuestro modelo.

 

Jornada 5

 

Procedimientos básicos para el tratamiento, limpieza y validación geográfica de datos de biodiversidad

14 de febrero de 2023

Imparte: Cristina Ronquillo

Objetivos

  • Conocer los principales aspectos necesarios para evaluar, filtrar, corregir y validar geográficamente conjuntos de datos de biodiversidad.
  • Establecer el tratamiento básico que debemos dar a los datos que descargamos de repositorios públicos como GBIF para poder utilizarlos en nuestra investigación.
  • Aprender a validar geográficamente los datos generados en el proceso de investigación propio o aquellos recolectados por múltiples investigadores en un proyecto y detectar los errores más habituales.

Material necesario

Un ordenador por participante con acceso a internet y los programas QGIS 3.22 (software libre), RStudio y Excel instalados.

Aprendizaje

  • En esta jornada aprenderás el procedimiento metodológico que se debe realizar cuando se trabaja con información geográfica en datos de biodiversidad.
  • Cuáles son los métodos para validar y corregir geográficamente los registros obtenidos en campo o de repositorios para generar un conjunto de datos final validado, fiable y cumpliendo unos criterios de calidad que se ajusten al objetivo de investigación.
  • Para ello, se explicarán procesos de análisis espacial sencillos en QGIS y R que nos ayuden a configurar un conjunto de datos sin errores.
  • Se mostrará también el flujo de trabajo básico y los errores más comunes a la hora de trabajar con información geográfica en registros de biodiversidad.
  • Además, analizaremos los términos y estándares principales de información que debe tener un conjunto de datos de biodiversidad para poder trabajar con ellos y compartirlos.

Contenidos

  1. Obtención de datos de repositorios públicos en abierto: ¿cuáles son los principales?, ¿qué estructura tienen y qué información contienen? (GBIF, ALA, digitalCSIC, OBIS…)
  2. Descarga de un set de datos, visualización de filtros previos y cómo afectan a los conjuntos de datos obtenidos.
  3. Términos y estándares usados en bases de datos de biodiversidad. Comprender los campos del estándar DarwinCore. Buenas prácticas para montar nuestros sets de datos y subirlos a repositorios públicos.
  4. Errores geográficos comunes en conjuntos de datos públicos, problemas de precisión en las coordenadas y detección de registros duplicados.
  5. Validación geográfica de los registros. Métodos de análisis espacial para comprobar si los registros de una especie están correctamente localizados.
  6. Recuperar información geográfica cuando no tenemos coordenadas: uso de gaceteros.
  7. Paquetes de R para limpieza de registros de biodiversidad.

Se realizarán dos prácticas con las que poder establecer las diferencias de tratamiento de datos según el tamaño y origen de los mismos.

Práctica 1. Análisis de los errores geográficos más comunes en un conjunto de datos pequeño obtenido en campo.

Práctica 2. Evaluación de un conjunto grande de datos geográficos a nivel global obtenido de un repositorio público.

 

Jornada 6

 

Tratamiento de datos espaciales para cambio climático con R

16 de febrero de 2023

Imparte: Mario Mingarro

 

Objetivos

Los datos espaciales son indispensables para el estudio de la biodiversidad. Conocer cómo tratar estos datos puede ser una herramienta muy útil. En este seminario se explorarán, mediante el lenguaje de programación R, diferentes técnicas de manejo y visualización de datos espaciales, tanto en formato ráster como en formato vectorial. También se repasarán algunos conceptos de los SIG.

Material necesario

Un ordenador por participante con acceso a internet, R, RStudio y Excel instalados.

Aprendizaje

En esta jornada se aprenderá el procedimiento metodológico para extraer datos climáticos pertenecientes a unas localidades concretas. Además, se enseñará cómo trabajar de manera eficiente, mediante bucles, y a cómo presentar estos datos de manera visual. Mediante dos prácticas se asentarán algunos conceptos básicos para obtener información abiótica y posteriormente poder utilizarla en diversos análisis.

Contenidos

  1. Breve introducción a funciones para el manejo de datos espaciales.
  2. Manejo de bucles para la automatización de procesos.
  3. Descarga y visualización de datos en Rstudio.
  4. Extracción de datos ráster a partir de puntos basados en latitud y longitud en Rstudio.
  5. Análisis del patrón de los datos espaciales basados en modelos lineales en Rstudio.
  6. Presentación de resultados de manera visual en Rstudio.

Se realizarán dos prácticas con las que poder asimilar los diferentes procesos explicados.

Práctica 1. Descarga de datos climáticos para una región concreta, basada en bucles, mediante Rstudio.

Práctica 2. Extracción, y posterior visualización de valores de temperatura en localidades concretas.

 

Jornada 7

 

Hacer un mapa para publicaciones científicas con QGIS, software libre.

21 de febrero de 2023

Imparte: Victoria González

Objetivos

Mejorar la calidad de la cartografía que presentamos en las publicaciones científicas y en las presentaciones a congresos utilizando recursos online disponibles como servicios WMS.

Material necesario

Un ordenador por participante con QGIS3.22 instalado.

Aprendizaje

A hacer mapas visualmente atractivos y correctos técnicamente.

Contenidos

  1. Elementos del mapa.
  2. Tipología de mapas.
  3. Búsqueda de información base para el mapa en internet.
  4. Utilización de servicios WMS.
  5. Volcado de información desde un CSV.
  6. Composición del mapa.
  7. Exportación del mapa.

 

Jornada 8

 

Teledetección fácil

23 de febrero de 2023

Imparten: Jorge Rey y Victoria González

Objetivo

Elaborar capas de información de teledetección con herramientas online.

Material necesario

Un ordenador por participante con acceso a internet.

Aprendizaje

Manejar herramientas online que te permiten usar información de sensores satelitales para tus proyectos.

Contenido

  1. Principios básicos de teledetección.
  2. Manejar herramientas online de teledetección.
  3. Elegir un área de trabajo.
  4. Elegir un sensor.
  5. Elegir una imagen.
  6. Hacer una clasificación de la imagen.
  7. Calcular índices de vegetación.
  8. Hacer una comparación de imágenes visual.
  9. Crear un time lapse.
  10. Descargar los resultados en distintos formatos.
  11. Hacer un análisis de datos utilizando herramientas de intersección y reclasificación.

 

*Imagen de portada: NASA obtenida de Unsplash.

Fecha

  • Martes, 31 Enero 2023
  • Jueves, 23 Febrero 2023

Horario

31 de enero de 2023

2,7,9, 14, 16, 21 y 23 de febrero de 2023 - Martes y jueves de cada semana.

De 9:30 a 13:30 (4 horas)

Ubicación

Online y presencial en el edificio de Zoología del MNCN

Tarifas

Jornadas gratuitas

Inscripción