Jornadas de Geografía Informática en el MNCN (Tercera Edición)

El Laboratorio de Biogeografía Informática y la Vicedirección de Formación del Museo Nacional de Ciencias Naturales (MNCN-CSIC) organizan la tercera edición de las Jornadas Geográficas, unas sesiones formativas sobre los aspectos básicos del trabajo con datos geoespaciales.

Dirigido a: investigadores, estudiantes y ayudantes de investigación del MNCN.

Duración: cada sesión será de 4 horas. Comenzando a las 9,30 horas.

Metodología: explicación de conceptos teóricos y ejecución de ejercicios prácticos en el ordenador alternativamente.

Lugar: sala de reuniones del edificio zoología.

Fechas: 18 y 25 de enero; 1,8,15 y 22 de Febrero; 1 de Marzo de 2022.

Curso presencial, necesaria la inscripción previa escribiendo a:  formacion@mncn.csic.es

Jornada 1

 

Toma de información en campo digital. Proceso de gestión de información geográfica desde el campo al modelo estadístico completamente digital

Fecha

18 de enero de 2022

Objetivos

Con el objetivo de mejorar la calidad de la información geográfica producida durante el proyecto científico, se ofrece un sistema de gestión de esta información completamente digital en el que se utiliza software libre y dispositivos preexistentes. Una jornada práctica donde podremos generar un proyecto, tomar información y descargarla en nuestro ordenador. Conociendo los metadatos que tiene cada una de las informaciones que manejamos y cómo podemos armonizar estos metadatos para su posterior tratamiento y análisis, en hojas de cálculo o programas estadísticos.

Material necesario

Un smartphone con espacio, con Epicolect5 y IGN Mapas de España instalados y un ordenador por participante con Excel instalado.

Aprendizaje

Toma de datos de campo geográficos y temáticos de forma rápida y eficaz, traslado a un servidor y descargarlos en el propio ordenador,

Contenidos

-Necesidad de tomar los datos en campo digitalmente y cómo hacerlo.

-Generar un proyecto adaptado, qué informaciones se pueden recoger y cómo diseñarlo.

-Hacer un ejercicio práctico de diseño, toma de datos, subida al servidor, descarga en local.

-Y tratamiento final de la información capturada.

Jornada 2

 

Nociones básicas de sistemas de información geográfica aplicados a las ciencias naturales

Fecha

25 de enero de 2022

Objetivos

Conocer utilidades de los sistemas de información geográfica aplicados a las ciencias naturales. Saber qué es un SIG, cómo se guardan los datos dentro de él, qué estructura tienen, cómo podemos utilizarlos para guardar los puntos de toma de datos en campo con toda la información capturada en ellos y completar la información temática de nuestro proyecto de investigación. Así como generar informes que nos sirvan en el proyecto.

Material necesario

Un ordenador por participante con el software QGIS 3.16 o posterior, software libre instalado.

Aprendizaje

Aprenderemos cómo leer la información de diferentes formatos, cómo consumir un servicio online de cartografía con un navegador pesado, modificar la información, superponerla correctamente, atendiendo a su sistema de referenciación, su precisión, usar varias informaciones disponibles en internet, cargarla en tus bases de datos y exportarla.

Contenidos

-Introducción: qué es un SIG y para qué sirve en un proyecto de ciencias naturales.

-Qué tipos de información almacena.

-Qué informaciones es importante cargar en la base de datos y cómo gestionarla.

-Qué comandos pueden ser útiles para nuestro proyecto.

-Cómo exportar información para meterla en nuestro modelo.

Jornada 3

 

Procedimientos básicos para el tratamiento, limpieza y validación geográfica de datos de biodiversidad

Fecha

1 de febrero de 2022

Objetivos

Conocer los principales aspectos necesarios para evaluar, filtrar, corregir y validar geográficamente conjuntos de datos de biodiversidad. Establecer el tratamiento básico que debemos dar a los datos que descargamos de repositorios públicos como GBIF para poder utilizarlos en nuestra investigación. Aprender a validar geográficamente los datos generados en el proceso de investigación propio o aquellos recolectados por múltiples investigadores en un proyecto y detectar los errores más habituales.

Material necesario

Un ordenador por participante con acceso a internet y los programas QGIS 3.16 o posterior (software libre), RStudio y Excel instalados.

Aprendizaje

En esta jornada aprenderás el procedimiento metodológico que se debe realizar cuando se trabaja con información geográfica en datos de biodiversidad. Cuáles son los métodos para validar y corregir geográficamente los registros obtenidos en campo o de repositorios para generar un conjunto de datos final validado, fiable y cumpliendo unos criterios de calidad que se ajusten al objetivo de investigación.

Para ello se explicarán procesos de análisis espacial sencillos en QGIS y R que nos ayuden a configurar un conjunto de datos sin errores. Se mostrará también el flujo de trabajo básico y los errores más comunes a la hora de trabajar con información geográfica en registros de biodiversidad.

Además, analizaremos los términos y estándares principales de información que debe tener un conjunto de datos de biodiversidad para poder trabajar con ellos y compartirlos.

Contenidos

-Obtención de datos de repositorios públicos en abierto: ¿cuáles son los principales? ¿Qué estructura tienen y qué información contienen? (GBIF, ALA, digitalCSIC, OBIS…)

Descarga de un set de datos, visualización de filtros previos y cómo afectan a los conjuntos de datos obtenidos.

-Términos y estándares usados en bases de datos de biodiversidad. Comprender los campos del estándar DarwinCore. Buenas prácticas para montar nuestros sets de datos y subirlos a repositorios públicos.

-Errores geográficos comunes en conjuntos de datos públicos, problemas de precisión en las coordenadas y detección de registros duplicados.

-Validación geográfica de los registros. Métodos de análisis espacial para comprobar si los registros de una especie están correctamente localizados.

-Recuperar información geográfica cuando no tenemos coordenadas: uso de gaceteros.

-Paquetes de R para limpieza de registros de biodiversidad.

Se realizarán dos prácticas con las que poder establecer las diferencias de tratamiento de datos según el tamaño y origen de los mismos.

Práctica 1. Análisis de los errores geográficos más comunes en un conjunto de datos pequeño obtenido en campo.

Práctica 2. Evaluación de un conjunto grande de datos geográficos a nivel global obtenido de un repositorio público.

Jornada 4

 

Nociones básicas de sistemas de referenciación geográfica

Fecha

8 de febrero de 2022

Objetivos

Conocer y entender nociones de los sistemas de referenciación geográfica. Saber en qué sistema está cada una de las informaciones que incluimos en nuestros modelos y cómo podemos utilizar herramientas correctas de conversión entre unos sistemas de referenciación geográficos y otros, para poder ingresar la información correctamente georeferenciada y proyectada en nuestros cálculos. También aprender sistemas de conversión de formatos de las coordenadas utilizando conversores programados por servicios públicos oficiales. Ser capaces de entender los metadatos de la información recibida en los proyectos de investigación y manejarla adecuadamente en lo referente a sistemas de referenciación geográfica y proyecciones.

Siguiendo con las situaciones observadas en el MNCN trabajaremos con SRG modernos y antiguos, y como compatibilizar las muestras tomadas en la actualidad con capas de información descargadas de servidores. Como incluir la georreferenciación de las muestras guardadas en colecciones históricas o encontradas en publicaciones en los proyectos.

Material necesario

Un ordenador por participante con el software ArcGIS 10.8 instalado.

Aprendizaje

Leer metadatos geográficos y entenderlos. Sabrás en que proyección esta cada información que manejas y cuando tienes que intervenir o cuando son compatibles unas con otras. Qué herramientas puedes utilizar para homogeneizar la información y como aplicarlas resolviendo rápida y eficazmente un problema geográfico. Dominaras conceptos como geoide, elipsoide, datum, altura elipsoidal y altura ortométrica. Sabrás por qué tienes que conocerlos.

Contenidos

-Introducción: necesidad de orientación en nuestros datos científicos.

-Para tomar datos en campo necesitamos conocer las coordenadas y el sistema de referencia geográfica que utilizamos.

-Para usar cartografía temática digital tenemos que usar el mismo sistema de referencia geográfica que utilizamos en la toma de datos en campo para que esos datos coincidan antes de meterlos en un modelo.

-Distintos SRG en distintas épocas. ¿Por qué cambia tanto algo que en realidad permanece?

-La forma de la Tierra y las diferentes abstracciones con las que nos acercamos a ellas: Elipsoide, Geoide, relieve topográfico. Un repaso sencillo que nos ayuda a movernos por una realidad compleja.

Jornada 5

 

Los metadatos de información geográfica

Fecha

15 de febrero de 2022

Objetivos

Mejorar el proceso de búsqueda de información geográfica, mediante el uso de los metadatos de descubrimiento, exploración y explotación.

Material necesario

Un ordenador por participante con QGIS 3.16 o posterior instalado.

Aprendizaje

A entender los metadatos en distintos formatos y elegir la información adecuada para mi proyecto. Mejorar la búsqueda de información geográfica en los catálogos oficiales.
 

Conocer los términos e información básica necesaria para preparar los metadatos asociados a conjuntos de datos de registros biológicos generados en la investigación.

Contenidos

-Metadatos.

-Normativa: ISO19115, ISO19139, NEM.

-Herramientas para crear y validar metadatos geográficos.

-CatMDEdit.

-Servicio de catálogo.

-Ejercicio XML, entendiendo el XML.

-Ejercicio con QGIS.

-Estándares para generar metadatos de biodiversidad: Darwin Core y Dublin Core.

Jornada 6

 

Hacer un mapa para publicaciones científicas con QGIS, software libre.

Fecha

22 de febrero de 2022

Objetivos

Mejorar la calidad de la cartografía que presentamos en las publicaciones científicas y en las presentaciones a congresos. Utilizando recursos online disponibles.

Material necesario

Un ordenador por participante con QGIS 3.16 o posterior instalado.

Aprendizaje

A hacer mapas visualmente atractivos y correctos técnicamente.

Contenidos

-Elementos del mapa.

-Tipología de mapas.

-Búsqueda de información base para el mapa en internet.

-Utilización de servicios WMS.

-Volcado de información desde un CSV.

-Composición del mapa.

-Exportación del mapa.

Jornada 7

 

Teledetección fácil

Fecha

1 de marzo de 2022

Objetivo

Elaborar capas de información de teledetección con herramientas online.

Material necesario

Un ordenador por participante con acceso a internet.

Aprendizaje

A manejar herramientas online que te permiten usar información de sensores satelitales para tus proyectos

Contenido

-Principios básicos de teledetección.

-Manejar herramientas online de teledetección.

-Elegir un área de trabajo.

-Elegir un sensor.

-Elegir una imagen.

-Hacer una clasificación de la imagen.

-Calcular índices de vegetación.

-Hacer una comparación de imágenes visual.

-Crear un time lapse.

-Descargar los resultados en distintos formatos.

 

Imagen de portada: Pixabay